Aminorūgštys – chemijoje taip vadinama grupė organinių junginių, kurie turi mažiausiai po vieną amino grupę (-NH2) bei karboksilo grupę (-COOH). Pagal šių grupių tarpusavio padėtį struktūroje jos skirstomos į alfa, beta, gama ir t. t. aminorūgštis. Kiekvienas toks tipas pasižymi jam būdingomis savybėmis. Alfa - aminorūgčių amino ir karboksilo grupės susijungusios tik per vieną tarpinį atomą (paprasčiausias pvz.: 2-aminoetano rūgštis dar vadinama alfa - aminoetano rūgštimi), beta – per du tarpinius atomus (paprasčiausias pvz.: 3-aminopropano rūgštis arba beta - aminopropano rūgštis) ir taip toliau.
Alfa - aminorūgštys labai svarbios ir biochemijoje, o kadangi kitokio tipo nei alfa - aminorūgštys šioje srityje pasitaiko rečiau, tai paprastai kalbant apie biochemiją arba gamtinių junginių chemiją, jei nepaminimas rūgšties tipas, suprantama, kad ji priklauso „alfa“ tipui.
Aminorūgštis | Santrupa | Žyminti raidė | Šoninės grandinės poliškumas | Šoninės grandinės rūgštingumas ar bazingumas | Hidropatijos indeksas |
---|---|---|---|---|---|
Alaninas | Ala | A | nepolinė | neutrali | 1.8 |
Argininas | Arg | R | polinė | stipriai bazinė | -4.5 |
Asparaginas | Asn | N | polinė | neutrali | -3.5 |
Asparto rūgštis | Asp | D | polinė | rūgštinė | -3.5 |
Cisteinas | Cys | C | polinė | neutrali | 2.5 |
Glutamo rūgštis | Glu | E | polinė | rūgštinė | -3.5 |
Glutaminas | Gln | Q | polinė | neutrali | -3.5 |
Glicinas | Gly | G | nepolinė | neutrali | -0.4 |
Histidinas | His | H | polinė | silpnai bazinė | -3.2 |
Izoleucinas | Ile | I | nepolinė | neutrali | 4.5 |
Leucinas | Leu | L | nepolinė | neutrali | 3.8 |
Lizinas | Lys | K | polinė | bazinė | -3.9 |
Metioninas | Met | M | nepolinė | neutrali | 1.9 |
Fenilalaninas | Phe | F | nepolinė | neutrali | 2.8 |
Prolinas | Pro | P | nepolinė | neutrali | -1.6 |
Serinas | Ser | S | polinė | neutrali | -0.8 |
Treoninas | Thr | T | polinė | neutrali | -0.7 |
Triptofanas | Trp | W | nepolinė | neutrali | -0.9 |
Tirozinas | Tyr | Y | nepolinė | neutrali | -1.3 |
Valinas | Val | V | nepolinė | neutrali | 4.2 |
Aminorūgščių funkcija baltymuose
Aminorūgštys panaudojamos tartum įvairių formų plytelės statant baltymą. Bendras principas labai paprastas: DNR turi savyje ketvertainį kodą, kurio trys DNR bitai (dar vadinami „kodonais“) koduoja vieną rūgštį sekoje. Papildomi „start“ ir „stop“ kodonai nurodo, kad vienas baltymas baigtas ir kad metas dekoduoti kitą. Bet turint galvoje tai, jog baltymas – tai ne simbolių eilutė, procesas virsta neįveikiamu uždaviniu net galingiausiems superkompiuteriams. Padedami kitų baltymų ir veikiami cheminių sąveikų, kurias sukelia įvairios papildomos aminorūgščių grupės, baltymai suformuoja tartum vieną kiek galima tikslesnę detalę ląstelei. Paskui baltymas paruošiamas darbui į jį įjungiant papildomas grupes. Papildoma grupe gali būti bet koks kitas elementas: pradedant vitaminu ar reta aminorūgštimi ir baigiant metalo jonu. Ji gali būti tiek pasyvi, dažnai padedanti baltymui išsilaikyti savo vietoje ką nors traukdama, tiek aktyvi kaip fermentuose. Užbaigus tokį trijų pagrindinių stadijų gamybos procesą baltymai nugabenami į „darbo“ vietą, kur jau visas baltymas veikia kaip ištisas vienetas. Keli netinkamai baltyme išsidėstę atomai gali visiškai sutrikdyti jo veikimą. Tuomet jis išardomas ir pakeičiamas nauju.
Komentarų nėra:
Rašyti komentarą